老病出現(xiàn)新癥狀，老病原出現(xiàn)新變異
病原因子在環(huán)境壓力與機(jī)體免疫壓力下，不斷發(fā)生變異，出現(xiàn)新的變異株與血清型，如口蹄疫、
禽流感、鏈球菌等，病原因子毒力變異導(dǎo)致新的流行，甚至造成災(zāi)難性的后果。如禽流感對哺乳動物的毒力增強(qiáng)，導(dǎo)致人的感染;新型鏈球菌致人感染發(fā)病甚至死亡。
新出現(xiàn)和重新流行的傳染病危害性增大
狂犬病、布魯氏菌病、結(jié)核病、鏈球菌病、炭疽、乙型腦炎、口蹄疫、流感等，近幾年來發(fā)病率不斷回升，不僅威脅著養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展，而且對人類的健康也造成重大影響。
近年來全球一個共同的問題是人類越來越面臨著動物病原的威脅，如SARS和愛滋病等的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)，病原溯源都與動物有關(guān)。
高致病性禽流感原本只感染家禽發(fā)病，對水禽和哺乳動物不致病，而現(xiàn)在不僅能使水禽高度感染并能嚴(yán)重發(fā)病死亡，而且感染哺乳動物和人，并引起死亡。這警示隨著環(huán)境、氣候和生態(tài)的變化，某些動物病原已經(jīng)突破種間屏障，直接感染人，給人類造成巨大威脅。
細(xì)菌性疾病危害加劇
隨著集約化養(yǎng)殖的規(guī)模不斷擴(kuò)大，污染日益嚴(yán)重，細(xì)菌性疾病明顯增多，如巴氏桿菌、豬鏈球菌、大腸桿菌等細(xì)菌感染的危害已變得十分嚴(yán)重。
濫用抗生素等導(dǎo)致耐藥菌株普遍存在，并使一些體內(nèi)正常菌群成為致病菌群。同時由于臨床大量使用抗生素，造成產(chǎn)品藥物殘留含量增加、產(chǎn)品質(zhì)量下降、出口受阻，消費(fèi)者心里恐慌。
疫病發(fā)病周期縮短
豬口蹄疫的流行周期過去是5～10年流行1次，發(fā)展到3～5年流行1次，又從每年流行1次，現(xiàn)在是每年流行多次，夏季也常發(fā)生，發(fā)病周期大大縮短，間隔時間愈來愈短。
疾病流行的空間特征變化迅速
集約化養(yǎng)殖加大了疾病傳播速度與流行強(qiáng)度。全球經(jīng)濟(jì)一體化、世界貿(mào)易和旅游業(yè)的發(fā)展，不少原來呈地方性流行的疾病變成世界性流行。
多病原混合感染增多，使病情更加復(fù)雜化
當(dāng)前發(fā)生傳染病往往不是單一的病原體所致，而是兩種或兩種以上的病原體共同協(xié)同作用而造成的。多病原混合感染或繼發(fā)感染已成為發(fā)病的主要形式。
由于多病原的感染，使病畜禽所表現(xiàn)的臨床癥狀沒有診斷特異性，而是表現(xiàn)為一系列的綜合癥候群，使病情復(fù)雜化，增加臨床診斷的難度，也給疫病控制帶來困難，導(dǎo)致畜群發(fā)病率和死亡率增高，造成更大損失。
病癥非典型化，隨性感染增多
在疫病流行過程中，病原體受到外界環(huán)境及高度免疫力的影響，使一些病原體的毒力經(jīng)常發(fā)生改變，有的毒力變強(qiáng)、有的毒力變?nèi)?，出現(xiàn)了新的變異株和血清型。
加之畜群中的免疫水平不高或免疫抗體不一致，致使某些疫病在豬群中發(fā)生流行、并非典型化。比如豬鏈球菌病出現(xiàn)了血清2型，不僅能引起豬高發(fā)病，死亡率增大，而且引起人發(fā)病，成為一種新的人畜共患病病原體。