灰指甲患者在治愈一段時(shí)間后又出現(xiàn)了復(fù)發(fā)，大部分復(fù)發(fā)的指甲或趾甲是原受感染的指甲，而少部分患者連沒有感染的指甲或趾甲也出現(xiàn)感染。這說明灰指甲還沒有完全治愈，或出現(xiàn)了促進(jìn)再感染的因素。
灰指甲治療需要一個過程，治愈后還需要一定的鞏固期。如果沒有及時(shí)鞏固治療，可能造成真菌被抑制而沒有完全被殺死，因此很難保證不會出現(xiàn)死灰復(fù)燃。
灰指甲常不是一個單獨(dú)存在的疾病，灰指甲的病人往往同時(shí)伴有手足癬。手足癬和灰指甲的病原菌是相同的，包括皮膚癬菌(毛癬菌屬、表皮癬菌屬、小孢子菌屬)、念珠菌(假絲酵母菌)及非皮膚癬菌類真菌。只針對灰指甲治療，而沒有對整個手、足部進(jìn)行抗真菌治療，會導(dǎo)致手、足攜帶真菌反復(fù)感染指甲和趾甲。
有些患者經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)的療程，足部灰指甲完全治愈了，也經(jīng)過了鞏固治療，保證殺菌的完全性，并且也治療了腳癬，最后還是復(fù)發(fā)了。人們在對足部殺菌時(shí)，往往忽略了清潔自己的鞋襪，導(dǎo)致真菌寄生在鞋襪中，再次感染趾甲。